يضم علم الأجنة الكثير من الإتجاهات العلمية ذات العلاقة الوثيقة بعلم الأجنة ومنها:
1- علم الأجنة التجريبي:
ومن متعلقاته علم الاستنساخ، العقم، التلقيح الصناعي، وسائل منع الحمل، تأثير المواد الكيميائية والبيئية على الجنين... إلخ.
2- علم الأجنة المقارن:
ويهتم بمقارنة التكوين الجنيني في الطوائف المختلفة من الحيوانات.
3- علم الأجنة التطوري:
ويشمل دراسة مراحل التكوين سواء كانت دراسات وصفية أو تجريبية باستخدام وسائل التقنية الحديثة.
4- علم التشوهات الخلقية:
يبحث عن الأسباب التي تؤدي إلى التكوين غير الطبيعي بالتأثير على الأطوار الجنينية بعوامل عديدة منها المواد الكيميائية والإشعاع والوراثة والبيئة والهرمونات والأدوية....الخ
5- زراعة الأنسجة:
يختص هذا العلم بزراعة الخلايا والأنسجة والأعضاء والأجنة وزرع الخلايا الجنينية لعلاج الأمراض.
6- علم الأجنة الوصفي:
هو العلم الذي يدرس مراحل تكوين الجنين منذ بداية تكوين الأمشاج مروراً بعمليات الإخصاب والتفلج والكرة الجرثومية (المفلجة) Blastula والتبطين Gastrula ثم تكوين الأعضاء إلى مرحلة الخروج إلى الحياة بالفقس أو الولادة حتى طور البلوغ.
